>
Hur RNA-polymeraset "bestämmer sig" för att avsluta transkriptionen är en komplicerad historia
Hos E. coli finns åtminstone två olika sätt, som transkriptionen kan avslutas på. I det ena sättet behövs ett protein kallat ρ ("rho"). Det sättet kallas därför ρ-beroende terminering. Det andra sättet kräver inte ρ, och kallas därför ρ-oberoende terminering.
Mot slutet av transkriberingen skrivs ett långt palindrom av.
Det följs av en lång sträcka med adenin (i DNA-mallen), vilket alltså skrivs om till U i RNA-molekylen.
Man tror att det långa palindromet bildar en hårnålsögla.
Annons |
|
Gener som kräver ρ-beroende terminering saknar den långa poly-A-sträckan i DNA-mallen, men har ibland de sekvenser som behövs för att göra en hårnålsögla.
Man tror att RNA-polymeraset stannar upp antingen när denna hårnålsögla bildas eller av någon annan (ännu okänd) anledning.
ρ-proteinet förflyttar sig längs den nybildade RNA-molekylen tills det når det stoppade RNA-polymeraset
Det är möjligt att ρ-proteinet får RNA:t att släppa från DNA:t genom att snurra upp RNA-DNA-hybriden. Men den exakta mekanismen är inte känd.
Det är inte heller känt varför vissa gener är beroende av ρ-proteinet för sin terminering, medan andra inte är det.
Man kallar det post-transkriptionell behandling.
En del av de enzymer som katalyserar dessa reaktioner är själva RNA-molekyler!
Primärt transkript: Den nyligen syntetiserade RNA-strängen. Kallas också omoget RNA.
Allteftersom RNA-molekylen genomgår behandling, mognar det
Till slut är RNA:t moget: Det är redo att utöva sin funktion, vare sig det är mRNA, tRNA eller rRNA.
En speciell grupp, en 7-metyl-guanosin, fästs till 5'-änden av det omogna RNA:t med en ovanlig 5',5'-trifosfatbindning.
Dess funktion är i stora drag okända
De flesta gener hos ryggradsdjuren innehåller introner
Introner upptäcktes (Philip Sharp och Richard Roberts oberoende av varandra, 1977) när moget RNA fick hybridisera med fullständigt denaturerat DNA:
Dessa proteiner kallas på snRNPs efter engelskans "small nuclear ribonucleoproteins", men i dagligt tal säger man ofta "snurps".
snRNP-proteinerna bildar ett enzymkomplex, som kallas en spliceosom (efter engelskans ord för splitsning, splicing).
Med hjälp av energi från ATP klipps intronet bort, och exonerna kopplas samman.
Upptäcktes 1982 av Thomas Cech och hans medarbetare
Här har det omogna RNA:t en egen, enzymatisk aktivitet
Upptäckten att RNA kan ha katalytisk aktivitet är av avsevärd betydelse.
Det finns ytteligare typer av introner, men det går vi inte igenom här.
3'-änden av mRNA:t klyvs, och 80-250 adenylatgrupper sätts på, och bildar en poly(A)-svans.
Bildandet av en poly(A)-svans sköts av ett enzym kallat polyadenylatpolymeras, och kräver energi i form av ATP
Både 5'-huvan och poly(A)-svansen skyddar möjligen det mogna RNA:t från degradering (nedbrytning).
Många bakteriella mRNA-molekyler får också en poly(A)-svans, men hos dem påskyndar det snarare degraderingen.
Sekvenser klipps av från båda ändar
I ett fåtal fall finns även introner, som splitsas bort
Många kvävebaser och sockerrester i tRNA-molekylen förändras också kemiskt genom substitution eller addition av någon funktionell grupp.
< | Hur transkriptionen regleras: Lac-operonet | Omvänt transkriptas syntetiserar DNA med RNA som mall. | > |